112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5056 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5056  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
399 aa  812    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5058  beta-lactamase domain protein  60.4 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5057  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  55.76 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1991  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  26.03 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
295 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.23 
 
 
726 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.23 
 
 
726 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 
294 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.25 
 
 
682 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
451 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  24.72 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.73 
 
 
745 aa  57.4  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.36 
 
 
654 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.36 
 
 
773 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.03 
 
 
808 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
283 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.75 
 
 
771 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  23.62 
 
 
738 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.64 
 
 
773 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  24.1 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
773 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24 
 
 
772 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24 
 
 
772 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  22.18 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.47 
 
 
773 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.78 
 
 
814 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 
300 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 
300 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 
291 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  24.72 
 
 
348 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 
292 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  25.66 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.42 
 
 
812 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
300 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  25.84 
 
 
300 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.83 
 
 
773 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
300 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  25.84 
 
 
300 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
841 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
300 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  25.84 
 
 
300 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
300 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.8 
 
 
759 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.91 
 
 
679 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  28.57 
 
 
808 aa  51.2  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
896 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  23.86 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  22.26 
 
 
461 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  24.25 
 
 
747 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.44 
 
 
839 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  23.59 
 
 
454 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  23.36 
 
 
461 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  31.15 
 
 
979 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  22.63 
 
 
461 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0828  metallo-beta-lactamase superfamily protein, putative  27.45 
 
 
688 aa  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.74 
 
 
773 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2675  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.5 
 
 
783 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923098  normal  0.0587505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.05 
 
 
773 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  20.69 
 
 
761 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.1 
 
 
746 aa  49.7  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1682  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.5 
 
 
783 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1637  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.42 
 
 
761 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.594703  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.72 
 
 
774 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.79 
 
 
806 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.2 
 
 
811 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.16 
 
 
786 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.96 
 
 
758 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.882312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  40.79 
 
 
806 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1704  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.83 
 
 
783 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286912  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.28 
 
 
750 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  22.58 
 
 
795 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.82 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.41 
 
 
829 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.66 
 
 
752 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 
829 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 
829 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  24.4 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  22.26 
 
 
461 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  22.26 
 
 
461 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.29 
 
 
737 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  25.67 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.29 
 
 
738 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.08 
 
 
709 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  24.82 
 
 
826 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14730  DNA internalization-related competence protein ComA  25.47 
 
 
711 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0603479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.94 
 
 
795 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.82 
 
 
860 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.97 
 
 
794 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>