More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1326 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1326  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
126 aa  233  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
128 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  61.11 
 
 
126 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 
126 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  67.2 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 
122 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
128 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 
122 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
121 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
125 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
125 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
125 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
129 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
127 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
127 aa  107  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 
126 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
125 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
126 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
122 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  58.87 
 
 
123 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 
123 aa  103  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
123 aa  103  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
123 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
122 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 
125 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
128 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
126 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
122 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
123 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
125 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
125 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
122 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  54.55 
 
 
129 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
124 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
125 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  54.03 
 
 
122 aa  100  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
123 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 
124 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
126 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  46.03 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4474  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  56.64 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  59.84 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>