More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0478 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  100 
 
 		 406 aa  828    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  63.77 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  52.66 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  52.44 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  47.24 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  47.17 
 
 		 401 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  47.16 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  50.39 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.93 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.81 
 
 		 381 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.44 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.14 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  39.95 
 
 		 360 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  39.71 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  40.26 
 
 		 572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.26 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.29 
 
 		 370 aa  225  9e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.96 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.93 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  39.5 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.85 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.18 
 
 		 331 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.58 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  30.71 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  41.26 
 
 		 546 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.47 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  43 
 
 		 546 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  43 
 
 		 546 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  43 
 
 		 546 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  43 
 
 		 546 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  42.05 
 
 		 545 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  43 
 
 		 546 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  30.88 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  38.81 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  39.9 
 
 		 554 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  40.61 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  40.61 
 
 		 546 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  60.78 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  54.74 
 
 		 151 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  59.52 
 
 		 99 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  55.56 
 
 		 99 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  68.75 
 
 		 113 aa  110  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  53.68 
 
 		 175 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  50.53 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  52.53 
 
 		 153 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  58.02 
 
 		 97 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  58.02 
 
 		 97 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  57.32 
 
 		 156 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  57.32 
 
 		 150 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  59.26 
 
 		 97 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 		 154 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  58.75 
 
 		 156 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  56.1 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  57.32 
 
 		 150 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 		 101 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  53.61 
 
 		 137 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  53.61 
 
 		 137 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  50.96 
 
 		 137 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  54.12 
 
 		 103 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  53.61 
 
 		 137 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 		 190 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  50.96 
 
 		 137 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  53.66 
 
 		 154 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  53.61 
 
 		 137 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 		 170 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  53.68 
 
 		 137 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  36.22 
 
 		 154 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  49.44 
 
 		 155 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  47.86 
 
 		 137 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  49.49 
 
 		 155 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 		 137 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 		 137 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  51.06 
 
 		 101 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 		 137 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  53.66 
 
 		 154 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 		 137 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 		 137 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  56.1 
 
 		 175 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  52.94 
 
 		 142 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 152 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 143 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  53.66 
 
 		 180 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 165 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 165 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 155 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  55.84 
 
 		 147 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  39.71 
 
 		 155 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 162 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  45.37 
 
 		 161 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 162 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 162 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  43.27 
 
 		 153 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  55 
 
 		 139 aa  102  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  55 
 
 		 143 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  45.37 
 
 		 163 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  48.84 
 
 		 152 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  48.84 
 
 		 152 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  47.22 
 
 		 159 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  57.5 
 
 		 139 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  53.09 
 
 		 101 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>