71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7264 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 328 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  77.98 
 
 		 328 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  79.55 
 
 		 310 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  77 
 
 		 342 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  68.35 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  65.42 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  59.73 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  54.36 
 
 		 291 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  53.1 
 
 		 287 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  44.32 
 
 		 266 aa  225  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  41.06 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  42.92 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  42.92 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  41.6 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  30 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  30 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  28.14 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  27.31 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  28.46 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  28.69 
 
 		 253 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  27.76 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  27.06 
 
 		 251 aa  99.4  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 262 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  27.18 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  27.67 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  27.81 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  26.29 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  25.21 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  24.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  26.19 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  22.22 
 
 		 271 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  28.38 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  27.19 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  24.37 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  26.51 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  22.83 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  25.26 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  26.54 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  25.36 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  26.67 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  37.21 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  23.81 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  25.5 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  24.56 
 
 		 606 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  23.93 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  28.82 
 
 		 258 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  25.73 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  25.61 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  28.46 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  27.45 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  27.7 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  27.51 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  21.19 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  29.85 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  31.54 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  21.19 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  24.85 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  32.28 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  26.35 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  24.23 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  25 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7477  resiniferatoxin-binding phosphotriesterase-related protein  25.23 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  22.44 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  23.03 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  21.66 
 
 		 462 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  23.22 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  31.52 
 
 		 258 aa  43.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  24.24 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  23.57 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  23.19 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>