50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7256 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  35.24 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  35.51 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  28.07 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  35.05 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  32.71 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  31.48 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  35.24 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  31.48 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  35.85 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  33.96 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  36.27 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  29.81 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  29.46 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  30.36 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  33.02 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  31.07 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  34.02 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  34.02 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  33.71 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  30.56 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  25.69 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  28.7 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  31.63 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  26.55 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  33.73 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  32.88 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  27.78 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  25.74 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  26.17 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  32.58 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  26.42 
 
 		 114 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  27.19 
 
 		 120 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  30.84 
 
 		 126 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  27.62 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  29.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  29.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  29.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  29.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  27.12 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.251102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>