299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3998 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 
308 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  60.39 
 
 
309 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  59.8 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  60.26 
 
 
308 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  57.89 
 
 
312 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  58.86 
 
 
315 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  52.98 
 
 
314 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  53.36 
 
 
326 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  43.43 
 
 
331 aa  263  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  40.73 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.07 
 
 
308 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.67 
 
 
362 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  42.95 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  40.4 
 
 
306 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  42 
 
 
362 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.61 
 
 
343 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  39.94 
 
 
343 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  41.29 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  40.26 
 
 
345 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.33 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  39.8 
 
 
347 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41 
 
 
359 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  39.93 
 
 
311 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  40.19 
 
 
380 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  39.6 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  41.91 
 
 
374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  41.33 
 
 
354 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  41.61 
 
 
317 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.66 
 
 
355 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.85 
 
 
361 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  41 
 
 
354 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.67 
 
 
354 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 
354 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  35.79 
 
 
323 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  40.66 
 
 
361 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 
386 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  43.02 
 
 
380 aa  225  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  36.72 
 
 
321 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 
379 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  39.49 
 
 
380 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38 
 
 
355 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  39.16 
 
 
379 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.16 
 
 
379 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
384 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
384 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.16 
 
 
379 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  36.42 
 
 
408 aa  218  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  38.21 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  39.93 
 
 
385 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  38.06 
 
 
351 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  37.66 
 
 
368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  38.03 
 
 
374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.54 
 
 
349 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
379 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  36.94 
 
 
379 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 
379 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  36.45 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.06 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  37.21 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  42.09 
 
 
404 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.57 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  38.91 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  41.4 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  42.41 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.24 
 
 
388 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  38.89 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.89 
 
 
409 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.58 
 
 
409 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  37.42 
 
 
320 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.91 
 
 
360 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 
397 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 
382 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.58 
 
 
409 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  37.5 
 
 
369 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.58 
 
 
409 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  38.59 
 
 
438 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  38.49 
 
 
366 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 
409 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 
409 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  37.8 
 
 
411 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.37 
 
 
368 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 
409 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  36.45 
 
 
385 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  40.7 
 
 
382 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  34.9 
 
 
331 aa  209  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  37.14 
 
 
372 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.42 
 
 
357 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>