25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1411 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  44.26 
 
 		 1222 aa  1071    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  47.07 
 
 		 1224 aa  1117    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  40.99 
 
 		 855 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  100 
 
 		 1223 aa  2524    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  32.96 
 
 		 1263 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  37.21 
 
 		 870 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  30.6 
 
 		 1243 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1237 aa  565  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  36.25 
 
 		 844 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1228 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  30.46 
 
 		 917 aa  363  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  29.26 
 
 		 913 aa  360  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  30.01 
 
 		 886 aa  357  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  29.26 
 
 		 913 aa  352  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  28.04 
 
 		 913 aa  351  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  30.56 
 
 		 925 aa  346  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  27.17 
 
 		 414 aa  58.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 416 aa  55.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  25.29 
 
 		 474 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 430 aa  50.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  27.17 
 
 		 414 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 653 aa  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  23.44 
 
 		 388 aa  46.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1924  surface antigen (D15)  26.52 
 
 		 516 aa  45.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.112702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  26.59 
 
 		 427 aa  45.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>