More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0216 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  870    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 423 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 423 aa  554  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 423 aa  525  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 423 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 430 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  51.18 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 423 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 422 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 422 aa  358  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 422 aa  356  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 432 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 431 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 426 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 422 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 444 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 428 aa  349  6e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 424 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  348  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 423 aa  348  8e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 426 aa  348  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 420 aa  346  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 427 aa  345  7e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 423 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 430 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  45 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>