More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3413 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  100 
 
 		 339 aa  695    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  53.64 
 
 		 329 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  52.41 
 
 		 341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  46.88 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  46.88 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  45.9 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  45.9 
 
 		 334 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  45.59 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  45.15 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  45.59 
 
 		 334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  45.29 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  42.07 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1807  asparaginase  40.3 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0241049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  40.18 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  38.32 
 
 		 340 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3330  L-asparaginase, type I  36.29 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519795  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  35.15 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  34.68 
 
 		 439 aa  185  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  35.88 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  36.66 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  31.38 
 
 		 451 aa  182  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  32.94 
 
 		 336 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  32.94 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  34.28 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  33.63 
 
 		 415 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  34.39 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  34.8 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  34.41 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  33.91 
 
 		 410 aa  178  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  34.88 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  36.13 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  34.88 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  35.45 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  34.33 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  35.78 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  34.33 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  34.99 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  34.88 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2312  cytoplasmic asparaginase I  35.63 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000448344  hitchhiker  0.000363201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  32 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  33.91 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  34.91 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2421  cytoplasmic asparaginase I  34.67 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  34.91 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  33.82 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  34.91 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  35.34 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  34.71 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  34.21 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  33.9 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  33.9 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  35.88 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  33.9 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  34.4 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  33.52 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  34.8 
 
 		 360 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  33.9 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  34.77 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  33.62 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  34.6 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  33.53 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  32.05 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  32.48 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  33.71 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  34.78 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  33.04 
 
 		 417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  32.47 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  34.8 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  30.97 
 
 		 411 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2037  asparaginase  33.91 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  32.74 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  32.75 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  32.95 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  32.79 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  30.77 
 
 		 410 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3607  asparaginase  33.13 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0495  asparaginase  31.88 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0529  asparaginase  31.88 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.974663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  32.07 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0159  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  33.77 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  30.72 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  32.37 
 
 		 424 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20905  predicted protein  33.22 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  32.95 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  32.58 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  31.62 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  31.44 
 
 		 418 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00170  asparaginase, putative  30.39 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000410367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>