More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1912 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
537 aa  1093    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.21 
 
 
507 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.62 
 
 
502 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 
507 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
521 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
506 aa  183  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
522 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.12 
 
 
516 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  26.74 
 
 
525 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
521 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 
528 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  25.76 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  30.38 
 
 
520 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  27.08 
 
 
529 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  27.97 
 
 
519 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  27.74 
 
 
477 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  25.84 
 
 
510 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  26.49 
 
 
541 aa  153  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 
511 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
510 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.41 
 
 
523 aa  150  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  28.03 
 
 
475 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  25.27 
 
 
534 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
553 aa  150  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  25.75 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.98 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  25.19 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  27.08 
 
 
552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.39 
 
 
524 aa  147  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  25.59 
 
 
542 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
526 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
528 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  28.08 
 
 
516 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  26.71 
 
 
505 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.87 
 
 
536 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 
524 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  28.17 
 
 
518 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
504 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  26.42 
 
 
509 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 
491 aa  143  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  28.26 
 
 
532 aa  143  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  26.27 
 
 
537 aa  143  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  26.43 
 
 
512 aa  143  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.93 
 
 
510 aa  143  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  25.28 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  27.19 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  25.6 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  35.31 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  27.43 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26.47 
 
 
501 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
532 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  28.87 
 
 
505 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
515 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.17 
 
 
479 aa  140  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
464 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  25.7 
 
 
536 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  25.54 
 
 
507 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  26.63 
 
 
521 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  25.46 
 
 
509 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  29.45 
 
 
539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  27.71 
 
 
543 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  27.44 
 
 
509 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  29.53 
 
 
524 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  27.12 
 
 
511 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  26.24 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  28.06 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  32.3 
 
 
488 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 
524 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  26.24 
 
 
520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.19 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
511 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 
550 aa  133  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 
506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  26.69 
 
 
557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
543 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  24.79 
 
 
497 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 
537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
488 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
533 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  27.13 
 
 
506 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4463  apolipoprotein N-acyltransferase  25.09 
 
 
528 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 
512 aa  130  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  31.98 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  25.63 
 
 
573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>