203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1427 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1427  microcompartments protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.295339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3267  microcompartments protein  42.42 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.820154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4893  microcompartments protein  41.92 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  36.68 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  62.5 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  55.32 
 
 		 96 aa  99  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  65.91 
 
 		 91 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  65.91 
 
 		 97 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  66.67 
 
 		 96 aa  95.5  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  64.77 
 
 		 99 aa  94.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  58.62 
 
 		 93 aa  95.1  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  55.17 
 
 		 100 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0358  microcompartments protein  64.37 
 
 		 92 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  63.64 
 
 		 92 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  64.77 
 
 		 91 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  60.2 
 
 		 96 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  65.06 
 
 		 95 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  59.55 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  63.22 
 
 		 96 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  66.28 
 
 		 94 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  60.92 
 
 		 94 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  63.95 
 
 		 96 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  55.06 
 
 		 178 aa  88.6  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  62.07 
 
 		 95 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  57.32 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  60.23 
 
 		 104 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  57.32 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  48.84 
 
 		 102 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  60.47 
 
 		 105 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  61.63 
 
 		 94 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  56.1 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  47.67 
 
 		 114 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  61.63 
 
 		 95 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  57.95 
 
 		 111 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  48.84 
 
 		 102 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  47.67 
 
 		 103 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  59.49 
 
 		 99 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  47.67 
 
 		 103 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  52.13 
 
 		 102 aa  85.9  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  47.67 
 
 		 103 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  47.67 
 
 		 103 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  57.95 
 
 		 97 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  47.67 
 
 		 113 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  48.78 
 
 		 112 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  47.67 
 
 		 102 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  47.67 
 
 		 114 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  50 
 
 		 113 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  53.49 
 
 		 97 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  46.51 
 
 		 103 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  52.63 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1290  microcompartments protein  55.68 
 
 		 90 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  56.1 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  53.49 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  46.51 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  45.35 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  57.47 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  45.35 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  55.17 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  51.06 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  54.65 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  53.26 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  53.26 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  54.65 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  51.58 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  51.06 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  52.33 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  51.06 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  58.14 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  54.65 
 
 		 101 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  50 
 
 		 98 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  51.58 
 
 		 99 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  50 
 
 		 98 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  57.47 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  57.47 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  57.47 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  57.47 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  57.47 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  57.47 
 
 		 93 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  50 
 
 		 97 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  53.49 
 
 		 98 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  46.51 
 
 		 102 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  53.49 
 
 		 98 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  53.49 
 
 		 99 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  55.7 
 
 		 91 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>