201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1415 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1415  microcompartments protein  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  69.23 
 
 		 198 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  70.53 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  64.21 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  74.47 
 
 		 208 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  51.69 
 
 		 93 aa  87  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  54.12 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  50 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  55.17 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  53.66 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  51.11 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  50 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  54.43 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  47.25 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  50 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  50 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  52.22 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  48.89 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  48.89 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  48.89 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  48.89 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  48.89 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  53.41 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  48.89 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  51.11 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  51.11 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  51.11 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  51.11 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  46.94 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  51.11 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  46.34 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  47.56 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  50 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  47.78 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  51.06 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  45.92 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  51.22 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  40.62 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  52.27 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  53.33 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  51.11 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  44.9 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  44.9 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  45.12 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4329  microcompartments protein  45.98 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  46.34 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  46.94 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  50 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  49.38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  46.94 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  51.11 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  50.55 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  47.92 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  52.38 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  47.56 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  51.11 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2157  microcompartments protein  45.05 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  44.19 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  43.96 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  44.19 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  51.14 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  48.91 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  50.57 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  45.88 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  45.88 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  44.71 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  51.16 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  45.88 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  43.62 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  50.6 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  45.12 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  50.6 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  45.88 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  45.88 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4710  microcompartments protein  41.76 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000470001  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2648  major carboxysome shell protein 1A (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  44.05 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  43.68 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  44.44 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  44.44 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  51.81 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  43.16 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  44.71 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  44.71 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  44.71 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>