66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2062 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  76.34 
 
 		 412 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  74.08 
 
 		 412 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 422 aa  864    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  78.24 
 
 		 411 aa  669    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  78.02 
 
 		 415 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  76.59 
 
 		 412 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  71.39 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  47.71 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  48.67 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  49.14 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  37.26 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  36.51 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  34.87 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  34.03 
 
 		 516 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  34.69 
 
 		 535 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  36.09 
 
 		 508 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  36.93 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  34.12 
 
 		 512 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  34.14 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  33.9 
 
 		 540 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  33.81 
 
 		 521 aa  252  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  33.56 
 
 		 468 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  33.65 
 
 		 534 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  35.01 
 
 		 502 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  34.52 
 
 		 502 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  33.41 
 
 		 513 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  34.05 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  33.49 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.29 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.15 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.65 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.66 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.65 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.76 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.53 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.78 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.38 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  27.14 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.46 
 
 		 460 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.1 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.79 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.11 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.86 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.91 
 
 		 530 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.03 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  21.3 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.25 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.45 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.2 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.86 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.67 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  18.88 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.29 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.47 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  23.16 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.63 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.12 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.35 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  20.64 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0281  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.81 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0757727  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.98 
 
 		 525 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.36 
 
 		 485 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.28 
 
 		 506 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.28 
 
 		 516 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.41 
 
 		 531 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>