43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1372 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  66.67 
 
 		 290 aa  350  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  45.31 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  46.55 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  60 
 
 		 355 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  44.07 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  47.92 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  44.23 
 
 		 728 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  44.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  36.21 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  35.29 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  42.22 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  42.86 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 		 161 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  47.73 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  39.29 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0261  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  52.38 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  47.73 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  34.62 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  45 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  44.68 
 
 		 361 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.85 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.75 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  34.67 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 172 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  36.36 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  28.85 
 
 		 385 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  32.08 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  53.33 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  32.81 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  43.33 
 
 		 359 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  46.67 
 
 		 359 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  39.34 
 
 		 149 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>