More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1980 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  100 
 
 		 451 aa  897    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  63.47 
 
 		 449 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  60.36 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  46.41 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  42.7 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1629  magnesium transporter, MgtE  44.1 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0142198  hitchhiker  0.00754264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  42.7 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  37.44 
 
 		 450 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  35.51 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.71 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  31.35 
 
 		 449 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  34.9 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.13 
 
 		 470 aa  236  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  34.92 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.64 
 
 		 456 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.41 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  32.42 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  32.13 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.41 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.51 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  32.43 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  34.52 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  35.07 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  33.71 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  33.57 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  30.43 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  30.43 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  30.93 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  32.82 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  30.39 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.49 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  33.1 
 
 		 473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  31.21 
 
 		 445 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  32.13 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  31.47 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  31.33 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  33.84 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  31.33 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  31.04 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  31.3 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  33.1 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.95 
 
 		 458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  31.93 
 
 		 447 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  32.01 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  30.36 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  31.39 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  29.5 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  29.5 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.41 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  30.16 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  28.64 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  28.96 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  30.5 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  30.13 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  28.96 
 
 		 480 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  30.39 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.33 
 
 		 473 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  29.98 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  31.53 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  29.36 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  30.68 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.77 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  28.79 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  31.29 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  28.73 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  31.61 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  29.77 
 
 		 480 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  28.64 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  30 
 
 		 481 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  30.18 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  28.76 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  31.25 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  30.16 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  29.09 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  32.41 
 
 		 468 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  29.09 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  32.33 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  29.87 
 
 		 463 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  29.12 
 
 		 480 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  28.86 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  31.53 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  33.11 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  30.66 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  30.54 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  28.83 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  28.83 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  31.12 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  29.1 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  30.63 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  29.61 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  29.48 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  30.37 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.06 
 
 		 542 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  29.81 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  29.3 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  29.5 
 
 		 458 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  31.29 
 
 		 422 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>