More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1171 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  86.89 
 
 		 127 aa  229  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  85.96 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 128 aa  203  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  72.66 
 
 		 129 aa  199  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  72.65 
 
 		 135 aa  191  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  72.65 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  71.64 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  58.65 
 
 		 131 aa  166  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  63.06 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  160  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  54.89 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  58.54 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  54.89 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04498  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  57.66 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  53.33 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  53.33 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  53.33 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  54.89 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  54.89 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0516  30S ribosomal protein S11  53.38 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.704694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  54.89 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  54.89 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  57.98 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0455  30S ribosomal protein S11  52.63 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.348659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  58.82 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  54.84 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2349  30S ribosomal protein S11  59.29 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  57.98 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  52.63 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  52.63 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  53.38 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  52.63 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>