19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0568 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  100 
 
 		 1426 aa  2916    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.22 
 
 		 1037 aa  145  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  24.4 
 
 		 1079 aa  133  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1066 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1166 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.2 
 
 		 1064 aa  127  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.58 
 
 		 1068 aa  125  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  28.09 
 
 		 1003 aa  124  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.98 
 
 		 984 aa  118  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1064 aa  102  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.37 
 
 		 1131 aa  100  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.86 
 
 		 1021 aa  98.6  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.79 
 
 		 1195 aa  83.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  25.23 
 
 		 1121 aa  77.4  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.91 
 
 		 1259 aa  66.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.08 
 
 		 1173 aa  65.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  21.59 
 
 		 1138 aa  59.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1370 aa  48.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  25.89 
 
 		 1388 aa  47.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>