42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0202 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 253 aa  531  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  31.63 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  30.84 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  28.57 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  27.88 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  27.71 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  26.5 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  26.34 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  26.55 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  25.82 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  26.55 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  27.14 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25.81 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  25.79 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  28.02 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  26.61 
 
 		 318 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  26.67 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  24.27 
 
 		 332 aa  86.3  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  28.25 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  27.49 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  27.6 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  26.42 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  23.83 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  28.65 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  23.92 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  25.32 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  26.34 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  23.98 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  26.85 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  21.53 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  22.59 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  23.44 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  20.57 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  23.32 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  26.63 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  26.47 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  27.21 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  21.95 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  20.17 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  19.91 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  21.43 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  23.12 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>