More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1767 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 331 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  74.84 
 
 		 323 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  72.39 
 
 		 337 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  66.15 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  67.48 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  63.01 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  60.19 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  52.76 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  46.01 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  45.17 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  44.62 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.75 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  46.11 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  46.1 
 
 		 331 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  45.17 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  47.14 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 		 318 aa  275  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  45.48 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  43.81 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  43.99 
 
 		 321 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  43.26 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  42.86 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  41.95 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  42.5 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  46.03 
 
 		 329 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  43.71 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  44.82 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  42.14 
 
 		 343 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  43.96 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.8 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  39.63 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  43.17 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  40.31 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.32 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  46.64 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  37.54 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 		 568 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  40.33 
 
 		 338 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  38.96 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  37.79 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  35.87 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  36.23 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  37.54 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  39.02 
 
 		 302 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.57 
 
 		 237 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.44 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.99 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.99 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.99 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  37.87 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.99 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.99 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.66 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  32.12 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 		 249 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  32.12 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>