More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1325 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  100 
 
 		 397 aa  811    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  58.16 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  59.18 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  58.42 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  52.84 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  46.25 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  45.8 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  44.66 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  46.19 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  44.9 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  44.56 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  44.76 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  45.43 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  45.94 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  44.97 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  43.33 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  45.01 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  42.93 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  43.83 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  44.36 
 
 		 396 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  44.5 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  45.31 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  42.89 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  45.19 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  44.05 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.9 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.15 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  43.7 
 
 		 411 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  42.75 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  44.91 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  41.84 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  43.55 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  44.87 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  44.25 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  43.8 
 
 		 371 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  42.42 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  42.93 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  43.22 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  39.95 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  39.25 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  42.93 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  43.67 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  43.58 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  43.43 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  45.15 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  45.15 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  43.26 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  43.07 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  43.26 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  41.98 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  40.25 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  38.35 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  42.82 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  44.19 
 
 		 404 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  40.45 
 
 		 403 aa  280  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  39.85 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  38.21 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  41.69 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  40.29 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  43.62 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  43.33 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  45.52 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  44.31 
 
 		 399 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  38.65 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  43.6 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  42.24 
 
 		 1305 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  42.6 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  42.48 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.15 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  37 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  42.86 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  40.1 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  39.45 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  42.13 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  41.54 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  37.75 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  38.12 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  42.17 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  39.85 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  42.35 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  40.68 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  37.09 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  39.75 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.7 
 
 		 589 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  40.91 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  42.21 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  38.35 
 
 		 399 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  38.21 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  40.1 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  44.81 
 
 		 1230 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  40.1 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  41.79 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2716  acetate kinase  39.85 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  39.3 
 
 		 406 aa  262  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  35.77 
 
 		 406 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  37.44 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  41.73 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  38.19 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  37.84 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>