98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1104 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  57.79 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  58.68 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  57.79 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  55.16 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  52.4 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  45.83 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  27.35 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  26.7 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.29 
 
 		 692 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  30.69 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  30.25 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  27.39 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 651 aa  70.5  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  29.15 
 
 		 623 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.61 
 
 		 645 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  29.35 
 
 		 660 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.86 
 
 		 660 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 612 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  24.56 
 
 		 330 aa  65.1  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.82 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.22 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.72 
 
 		 627 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  28.18 
 
 		 621 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 598 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  25.44 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  25.69 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.7 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.1 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.9 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  27.97 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.74 
 
 		 702 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  28.37 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  27.4 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.36 
 
 		 594 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  23.05 
 
 		 646 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.13 
 
 		 668 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  32.67 
 
 		 758 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  31.93 
 
 		 530 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  25.89 
 
 		 625 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.24 
 
 		 661 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.07 
 
 		 601 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  24.32 
 
 		 672 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0391  PASTA domain containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.99 
 
 		 736 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.09 
 
 		 650 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  25.37 
 
 		 290 aa  52  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.58 
 
 		 667 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1504  PASTA domain-containing protein  36.96 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  26.24 
 
 		 656 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.96 
 
 		 662 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.98 
 
 		 641 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  26.96 
 
 		 692 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.85 
 
 		 681 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  28.15 
 
 		 734 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.73 
 
 		 657 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.56 
 
 		 613 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.9 
 
 		 658 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 691 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  24.34 
 
 		 625 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.6 
 
 		 728 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 		 632 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.89 
 
 		 715 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.45 
 
 		 584 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.7 
 
 		 641 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 657 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.73 
 
 		 676 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 723 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.19 
 
 		 632 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.42 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  30.77 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 657 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 666 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  30.05 
 
 		 560 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 657 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.32 
 
 		 673 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.89 
 
 		 661 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 582 aa  45.4  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.91 
 
 		 626 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.33 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.05 
 
 		 653 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.08 
 
 		 718 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  25 
 
 		 501 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.07 
 
 		 607 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.09 
 
 		 613 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.88 
 
 		 693 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.09 
 
 		 668 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 642 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.36 
 
 		 647 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 624 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  25.43 
 
 		 584 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  30.16 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 657 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.65 
 
 		 662 aa  42.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.66 
 
 		 648 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>