More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0853 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
545 aa  1088    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  89.54 
 
 
545 aa  997    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.511316  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  88.26 
 
 
545 aa  974    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  85.29 
 
 
544 aa  954    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  87.52 
 
 
545 aa  976    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  89.34 
 
 
544 aa  995    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  92.66 
 
 
545 aa  1013    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1280  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.59 
 
 
554 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46 
 
 
549 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2580  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46 
 
 
549 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46 
 
 
549 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4908  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.2 
 
 
559 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.82 
 
 
535 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  41.6 
 
 
522 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.8 
 
 
525 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.7 
 
 
519 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.45 
 
 
535 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.76 
 
 
535 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2614  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain M  46.83 
 
 
564 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.03 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.64 
 
 
555 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.88 
 
 
495 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  41.93 
 
 
502 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  41.45 
 
 
502 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  41.74 
 
 
502 aa  382  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  40.9 
 
 
512 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40.73 
 
 
501 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  39.82 
 
 
510 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.6 
 
 
542 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.54 
 
 
525 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.6 
 
 
542 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.6 
 
 
542 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1295  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.1 
 
 
559 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.85 
 
 
503 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.37 
 
 
497 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  39.44 
 
 
513 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  39.44 
 
 
513 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  40.74 
 
 
503 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  40.52 
 
 
505 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 
489 aa  363  4e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  39.19 
 
 
513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  39.27 
 
 
521 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  40.37 
 
 
505 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  39.35 
 
 
503 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  39.54 
 
 
503 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.22 
 
 
491 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.19 
 
 
514 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.46 
 
 
527 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  39.26 
 
 
515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.27 
 
 
527 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  39.41 
 
 
505 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.5 
 
 
527 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.03 
 
 
494 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.37 
 
 
506 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.43 
 
 
521 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  39.03 
 
 
494 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.86 
 
 
534 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  39.19 
 
 
513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.51 
 
 
506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  39.59 
 
 
497 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  40 
 
 
497 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.93 
 
 
496 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.55 
 
 
504 aa  349  8e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  39.01 
 
 
488 aa  349  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  39.38 
 
 
488 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.29 
 
 
534 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  39 
 
 
502 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.73 
 
 
507 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.13 
 
 
509 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  38.6 
 
 
514 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.7 
 
 
507 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
496 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 
496 aa  347  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.63 
 
 
495 aa  346  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
496 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  38.26 
 
 
502 aa  346  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  38.56 
 
 
502 aa  346  7e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 
494 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.96 
 
 
522 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.676502  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  39.38 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0270  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.19 
 
 
559 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.256244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.64 
 
 
517 aa  343  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
496 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0693  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.48 
 
 
510 aa  342  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.41 
 
 
502 aa  342  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.35 
 
 
509 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1505  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.55 
 
 
491 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.185001  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0193  NADH dehydrogenase subunit M  39.05 
 
 
507 aa  341  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>