50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1379 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  100 
 
 		 234 aa  476  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  59.4 
 
 		 232 aa  288  6e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  60.26 
 
 		 232 aa  287  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  49.57 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  50.24 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  50.48 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  43.04 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  47.64 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  49.52 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  49.52 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  47.87 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  49.52 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  48.08 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  44.49 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  49.04 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  49.04 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  48.57 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  49.04 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  46.15 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  42.42 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  45.75 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  44.56 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  40.8 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  40.8 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  40.8 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  40.8 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  40.3 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  40 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  42 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  38.53 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  39.66 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  37.96 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  38.5 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  42.78 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  36.36 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  40 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  42.51 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  28.03 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  33.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  25.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  25.16 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  26.06 
 
 		 611 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>