More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1275 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1275  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 336 aa  671    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.94 
 
 		 335 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0287  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.94 
 
 		 335 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1364  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.64 
 
 		 335 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.79 
 
 		 336 aa  530  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.08 
 
 		 338 aa  529  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.04 
 
 		 340 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.55 
 
 		 343 aa  498  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0400  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.15 
 
 		 340 aa  482  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.25 
 
 		 337 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.8 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 		 337 aa  371  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  55.52 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.65 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.28 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.52 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.52 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.7 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.35 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.35 
 
 		 343 aa  364  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.09 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.04 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.28 
 
 		 338 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.91 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 355 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.14 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 339 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0575  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.26 
 
 		 331 aa  362  7.0000000000000005e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.77 
 
 		 352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.31 
 
 		 344 aa  360  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.39 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.04 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  54.77 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 		 351 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.8 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 		 342 aa  358  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.65 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.89 
 
 		 343 aa  358  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 348 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 		 334 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 349 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.11 
 
 		 336 aa  358  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.42 
 
 		 336 aa  358  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.13 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.96 
 
 		 334 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 338 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  54.8 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.81 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  53.11 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.11 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.11 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.34 
 
 		 336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.11 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.21 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.27 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.65 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>