More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0194 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.65 
 
 
294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.31 
 
 
294 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.97 
 
 
294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.81 
 
 
295 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.14 
 
 
295 aa  430  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.72 
 
 
295 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  63.85 
 
 
294 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0686  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.77 
 
 
296 aa  355  5e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0122169  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.15 
 
 
288 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.73 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 
287 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.81 
 
 
288 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
287 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
287 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.07 
 
 
287 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  34.68 
 
 
292 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.73 
 
 
287 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
289 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
290 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.54 
 
 
290 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
289 aa  185  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
291 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.34 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.34 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.78 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
289 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.97 
 
 
282 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
291 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  178  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.55 
 
 
291 aa  178  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  32.69 
 
 
305 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
290 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  32.89 
 
 
297 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.45 
 
 
298 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  35.81 
 
 
287 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  34.13 
 
 
287 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.54 
 
 
291 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  35.57 
 
 
294 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
287 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
288 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
288 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.77 
 
 
289 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  33.33 
 
 
285 aa  175  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  32.03 
 
 
302 aa  175  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
287 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
287 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
287 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
287 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.11 
 
 
287 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
287 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.73 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.56 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  34.23 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.2 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.95 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  33.67 
 
 
293 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32 
 
 
295 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  33.9 
 
 
286 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.42 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.42 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.42 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  33 
 
 
293 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>