More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0189 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  100 
 
 		 283 aa  556  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  60 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  59.64 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  60 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  55.48 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  53.19 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  51.05 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  52.65 
 
 		 286 aa  278  8e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  55.91 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  50 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  46.06 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  39.73 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  46.82 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  45.08 
 
 		 305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  42.7 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  38.7 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  38.74 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.79 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.79 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  39.26 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  46.26 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  47.86 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  34.98 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.31 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  39.93 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  37.88 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  35.44 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  39.53 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  35.56 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  38.49 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.79 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  49.51 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  37.46 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.18 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  35.62 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  37.46 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  37.46 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  36.76 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  39.37 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  39.31 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  41.25 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  45.18 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.7 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  36.05 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.64 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.25 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.64 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  34.86 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.78 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  35.76 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  36.68 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.06 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  36.61 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  41.09 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  35.37 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  39.6 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.45 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.92 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  45.95 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  34.36 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  35.21 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  35.89 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  47 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  37.85 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  35.76 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  37.54 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.85 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.43 
 
 		 289 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  36.9 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  35.37 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  39.38 
 
 		 422 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  38.18 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  41 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  35.02 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  36.93 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  38.74 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  43.78 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.85 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  35.93 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  36.01 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.67 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  42.53 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  37.28 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  38.19 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  36.24 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  38.02 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  35.17 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>