More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12050 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
470 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
470 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.27 
 
 
468 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1045  ATP synthase F1, beta subunit  84.45 
 
 
483 aa  818    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.711777  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.37 
 
 
473 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.46 
 
 
469 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.46 
 
 
469 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
479 aa  635    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.46 
 
 
469 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  86.4 
 
 
485 aa  854    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.68 
 
 
469 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  100 
 
 
479 aa  978    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.18 
 
 
468 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
470 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.27 
 
 
468 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.46 
 
 
469 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
462 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
472 aa  635    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.27 
 
 
464 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  77.7 
 
 
493 aa  714    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.3 
 
 
473 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  69.81 
 
 
471 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 
469 aa  641    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  69.25 
 
 
465 aa  639    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  71.55 
 
 
467 aa  654    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 
504 aa  638    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.18 
 
 
468 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 
476 aa  634  1e-180  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  64.08 
 
 
487 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.06 
 
 
462 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  67.97 
 
 
470 aa  624  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 
475 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
482 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.28 
 
 
462 aa  626  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  67.3 
 
 
470 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
465 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
465 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
469 aa  625  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
480 aa  626  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
467 aa  625  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.06 
 
 
462 aa  623  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.84 
 
 
482 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.28 
 
 
462 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4332  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.49 
 
 
480 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551629  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
462 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66.32 
 
 
482 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.76 
 
 
468 aa  624  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
470 aa  618  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.91 
 
 
465 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
476 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
481 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
474 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  67.69 
 
 
468 aa  618  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  65.62 
 
 
481 aa  618  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  67.31 
 
 
464 aa  619  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 
470 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.54 
 
 
468 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.54 
 
 
468 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.18 
 
 
503 aa  617  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.18 
 
 
462 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 
470 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
470 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
465 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 
470 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
464 aa  616  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 
475 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 
471 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
468 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
483 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.03 
 
 
463 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
483 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.89 
 
 
470 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
482 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.74 
 
 
470 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.79 
 
 
457 aa  611  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.24 
 
 
463 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.24 
 
 
463 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5168  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 
467 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.24 
 
 
463 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.27 
 
 
462 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  66.46 
 
 
547 aa  609  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0144  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.01 
 
 
464 aa  610  1e-173  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.801647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.01 
 
 
460 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.35 
 
 
471 aa  608  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.69 
 
 
458 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4255  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 
460 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 
460 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.35 
 
 
463 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 
466 aa  610  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.35 
 
 
463 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>