More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05340 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.28 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.73 
 
 
310 aa  354  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.54 
 
 
310 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  59.46 
 
 
318 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.42 
 
 
309 aa  333  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  55.52 
 
 
310 aa  333  3e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  59.06 
 
 
309 aa  332  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  60.66 
 
 
309 aa  332  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  57.86 
 
 
308 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  59.33 
 
 
309 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  54.52 
 
 
304 aa  329  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.04 
 
 
312 aa  328  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.48 
 
 
312 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  58.53 
 
 
309 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57.24 
 
 
311 aa  323  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.92 
 
 
310 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.92 
 
 
310 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  54.15 
 
 
304 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  53.95 
 
 
310 aa  319  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.23 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  54.61 
 
 
317 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.42 
 
 
308 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.96 
 
 
317 aa  315  5e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  54.73 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.48 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  59.67 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.15 
 
 
310 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  53.18 
 
 
304 aa  310  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  52.82 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.16 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  53.54 
 
 
310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  52.82 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  56.51 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  50 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  51.83 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  53.49 
 
 
309 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  52.49 
 
 
309 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  52.98 
 
 
311 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  57 
 
 
309 aa  305  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  50.5 
 
 
311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  55.89 
 
 
308 aa  305  8.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  53.8 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  54.52 
 
 
327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  55.48 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  53.82 
 
 
310 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  53.85 
 
 
309 aa  301  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  54.42 
 
 
309 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  52.3 
 
 
317 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  53.16 
 
 
316 aa  299  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  54.55 
 
 
308 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  51.97 
 
 
330 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  53.72 
 
 
308 aa  298  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  55.44 
 
 
311 aa  298  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  53.49 
 
 
311 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  54.61 
 
 
323 aa  297  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  53.16 
 
 
311 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  53.4 
 
 
312 aa  296  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  49.49 
 
 
302 aa  295  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  55.48 
 
 
307 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  55.1 
 
 
311 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  54.82 
 
 
310 aa  295  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  55.48 
 
 
307 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  55.22 
 
 
310 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  55.48 
 
 
307 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  55.48 
 
 
307 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  55.48 
 
 
307 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  55.48 
 
 
307 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  55.15 
 
 
307 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  54.21 
 
 
311 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  52.16 
 
 
324 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  53.87 
 
 
309 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.2 
 
 
311 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  51.46 
 
 
316 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  56.08 
 
 
309 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  55.15 
 
 
307 aa  292  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  55.48 
 
 
310 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  54.82 
 
 
307 aa  292  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  55.74 
 
 
309 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  54.82 
 
 
307 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  50.66 
 
 
320 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  52.2 
 
 
321 aa  291  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  51.99 
 
 
311 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  54.85 
 
 
317 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  53.67 
 
 
311 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.19 
 
 
309 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  50.98 
 
 
313 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  49 
 
 
311 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  50.83 
 
 
308 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  51.32 
 
 
319 aa  289  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  52.84 
 
 
317 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  52.33 
 
 
320 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  50.66 
 
 
320 aa  289  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  52.03 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  52.32 
 
 
311 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  53.16 
 
 
311 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  54.11 
 
 
306 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  56 
 
 
305 aa  286  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  53.54 
 
 
309 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  53.54 
 
 
316 aa  285  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>