More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01330  Co-chaperonin GroES  100 
 
 
95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2821  chaperonin Cpn10  74.19 
 
 
95 aa  142  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107479  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05480  Co-chaperonin GroES  73.12 
 
 
96 aa  141  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
95 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
95 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
94 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  55.79 
 
 
95 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
96 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
95 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  103  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
97 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
95 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  52.69 
 
 
97 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
96 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
95 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
96 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
95 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
96 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
97 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
96 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
99 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
97 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  48.91 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
98 aa  97.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 
98 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
94 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
94 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 
95 aa  96.7  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
97 aa  95.9  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
96 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  52.75 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  49.46 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  52.75 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  52.75 
 
 
98 aa  94.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  49.46 
 
 
97 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 
102 aa  94.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  50 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  50 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  50 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  53.19 
 
 
103 aa  94  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  48.39 
 
 
103 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  93.6  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  50 
 
 
96 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  45.26 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  45.26 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>