More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05480  Co-chaperonin GroES  100 
 
 		 96 aa  187  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2821  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 95 aa  152  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107479  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01330  Co-chaperonin GroES  73.12 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  58.06 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  54.17 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 100 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 100 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  59.34 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  58.24 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 97 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 		 102 aa  103  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  103  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  61.96 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  53.85 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  52.17 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>