44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1508 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  100 
 
 		 348 aa  712    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  30.12 
 
 		 593 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  30.99 
 
 		 589 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  30.81 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  28.93 
 
 		 362 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  29.69 
 
 		 592 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 		 641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 587 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  28.37 
 
 		 606 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  26.06 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  27.25 
 
 		 602 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.89 
 
 		 596 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  25.56 
 
 		 610 aa  89.4  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  21.41 
 
 		 407 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  25.69 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.36 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 589 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.64 
 
 		 589 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  24.44 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.85 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  29.68 
 
 		 589 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  21.13 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  25 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  24.36 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  23.86 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  22.57 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  24.8 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.71 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  26.5 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  23.14 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  21.3 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 		 604 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  24.15 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  22.92 
 
 		 595 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  25.14 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 574 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23.67 
 
 		 576 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  22.54 
 
 		 598 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  20.95 
 
 		 565 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  21.98 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  22.09 
 
 		 594 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  24.3 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2521  hypothetical protein  29.93 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>