More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1068 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
137 aa  287  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0704  arsenate reductase  70 
 
 
131 aa  201  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1304  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.22 
 
 
133 aa  196  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  67.69 
 
 
136 aa  194  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  60.77 
 
 
137 aa  180  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  63.64 
 
 
137 aa  175  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  68.03 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  68.03 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  56.35 
 
 
135 aa  143  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1732  arsenate reductase  49.23 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.044466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  52.8 
 
 
133 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  47.76 
 
 
137 aa  130  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  47.58 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1094  arsenate reductase  56.7 
 
 
106 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.31 
 
 
138 aa  94  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.46 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  37.21 
 
 
294 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.09 
 
 
453 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  38.4 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.92 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  39.23 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 
225 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  36.8 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.98 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  36.22 
 
 
144 aa  84.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
223 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  38.58 
 
 
498 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.15 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.88 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.71 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.52 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 
225 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.07 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  37.4 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 
222 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.17 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  36.57 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.77 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  38.79 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  37.3 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.54 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.62 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  34.92 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.17 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  35.88 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  38.62 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0337  ArsC  49.32 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  36.92 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.23 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  36.5 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  39.37 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.09 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  35.43 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  31.54 
 
 
337 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  36.15 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
174 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  34.31 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  35.34 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.96 
 
 
152 aa  67  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.37 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  34.65 
 
 
134 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  35.46 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  35.86 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.2 
 
 
408 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>