47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3690 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 
105 aa  203  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  38.61 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  37.14 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  40.28 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  38.67 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  40 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  28.95 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  36 
 
 
119 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  33.33 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  38.57 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  37.84 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  37.31 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  36.36 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  36.49 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  46.67 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  44.78 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  34.25 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  36.23 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  38.36 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  34 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  34 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  31.25 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  52.17 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  35.24 
 
 
178 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  32.84 
 
 
116 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2597  hypothetical protein  34.72 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  hitchhiker  0.000125377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  26.39 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  30.56 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  36.11 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  36.11 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  35.94 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  28.95 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  40.24 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
371 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  29.17 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.77 
 
 
353 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  33.33 
 
 
388 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  25.84 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  37.7 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  24.29 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  38.96 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  43.64 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  38.96 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>