49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3075 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  41.28 
 
 
172 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  37.16 
 
 
179 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  35.87 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  35.87 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  40.52 
 
 
171 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  36.54 
 
 
177 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  41.61 
 
 
176 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  36.42 
 
 
189 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  37.21 
 
 
179 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  37.04 
 
 
174 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  37.11 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  38.96 
 
 
175 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  33.68 
 
 
196 aa  98.2  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  35.67 
 
 
168 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  35.09 
 
 
202 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  37.2 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  32.92 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  37.2 
 
 
177 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  35.85 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  38.12 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  34.91 
 
 
187 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  38.12 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  37.04 
 
 
179 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  32.3 
 
 
168 aa  94  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  34.76 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  31.05 
 
 
195 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  34.81 
 
 
169 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  34.78 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  30.15 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  32.61 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  34.18 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  33.82 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  30.15 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  27.98 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  60.42 
 
 
201 aa  70.9  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  60.42 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  56.6 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  60.42 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  57.14 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  52.83 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  30.72 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  54.72 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  43.66 
 
 
220 aa  63.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  47.17 
 
 
232 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  28.03 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  29.22 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>