32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2629 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0482  hypothetical protein  55.45 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  26.94 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  24.84 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1532  putative spermidine synthase  29.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218383  normal  0.14893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  32.69 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  25.16 
 
 		 558 aa  55.1  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  30.08 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.93 
 
 		 516 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  34.42 
 
 		 475 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  31.3 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  33.53 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.41 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.65 
 
 		 533 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  32.17 
 
 		 320 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.03 
 
 		 502 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  25.93 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.36 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.36 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.36 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  21.47 
 
 		 558 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  26.86 
 
 		 471 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.34 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28.04 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  29.25 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  31.9 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  30.56 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  28.06 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1444  O-methyltransferase family protein  32.73 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  31.97 
 
 		 681 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  27.83 
 
 		 289 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>