216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2542 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  100 
 
 
405 aa  822    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  55.41 
 
 
449 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  50.13 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  50.13 
 
 
412 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  50.12 
 
 
413 aa  348  7e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  44.53 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  44.27 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  47.15 
 
 
444 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  37.47 
 
 
428 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  37.76 
 
 
444 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  34.25 
 
 
439 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  36.39 
 
 
431 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  36.45 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  32.84 
 
 
464 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  33 
 
 
447 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  32.44 
 
 
456 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  31.93 
 
 
472 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  31.45 
 
 
462 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  31.6 
 
 
450 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  32.52 
 
 
448 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  31.6 
 
 
448 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  36.93 
 
 
394 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  35.17 
 
 
399 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  30.61 
 
 
438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  31.93 
 
 
448 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  35.48 
 
 
412 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  35.62 
 
 
444 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  31.93 
 
 
338 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.16 
 
 
350 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  33.92 
 
 
388 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.89 
 
 
602 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  30.52 
 
 
423 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  31.85 
 
 
420 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  33.14 
 
 
433 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  33.43 
 
 
419 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  34.96 
 
 
412 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  36.73 
 
 
418 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  33.06 
 
 
390 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  30.85 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  31.39 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  32.76 
 
 
402 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.28 
 
 
311 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  30.77 
 
 
363 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  28 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.8 
 
 
311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.68 
 
 
328 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.33 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  27.79 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.87 
 
 
345 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  26.72 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.37 
 
 
313 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.68 
 
 
315 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 
433 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.11 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.55 
 
 
348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  26.72 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.88 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.97 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  26.49 
 
 
312 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  23.27 
 
 
311 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  24.56 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  24.81 
 
 
387 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  25.68 
 
 
393 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  26.45 
 
 
329 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.94 
 
 
355 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  23.73 
 
 
320 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.94 
 
 
355 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  29.37 
 
 
368 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  24.65 
 
 
320 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  34.44 
 
 
335 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  28.52 
 
 
306 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  24.12 
 
 
390 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  27.17 
 
 
394 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.04 
 
 
317 aa  99.8  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 
355 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  28.49 
 
 
307 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  26.1 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  25.28 
 
 
389 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  20.82 
 
 
397 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.45 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  26.51 
 
 
362 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  26.88 
 
 
393 aa  96.3  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  29.5 
 
 
379 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  25.33 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  27.61 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  26.09 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  23.87 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  23.87 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  23.87 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  23.87 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  23.87 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  24.71 
 
 
326 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  21.27 
 
 
323 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  25.48 
 
 
332 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.8 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  24.17 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  25.2 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  25.2 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  25.88 
 
 
323 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  24.59 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>