More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1915 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  604  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5154  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
302 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266092  normal  0.177147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.9 
 
 
314 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
319 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.69 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  34.7 
 
 
319 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  30.07 
 
 
325 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.93 
 
 
321 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.23 
 
 
325 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.29 
 
 
318 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  30.03 
 
 
325 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
320 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
320 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.7 
 
 
372 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 
318 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.7 
 
 
372 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
323 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  29.35 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
325 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
320 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.81 
 
 
321 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.81 
 
 
346 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.96 
 
 
666 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
319 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.9 
 
 
318 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.35 
 
 
321 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 
325 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 
318 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 
325 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.5 
 
 
325 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  36.4 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.19 
 
 
326 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
325 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.47 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.51 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.14 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.39 
 
 
324 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.15 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.99 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.52 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  29.39 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.46 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0050  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.38 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.15 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  27.67 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  27.67 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2183  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.85 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.63 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.01 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  30.12 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.81 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.46 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
324 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  31.8 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  28.63 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  32.84 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  28.24 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0152  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0861526  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.52 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  30.08 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.67 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>