81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1318 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  270  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  53.03 
 
 
138 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  47.76 
 
 
144 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  44.36 
 
 
144 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  45.52 
 
 
556 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  45.52 
 
 
556 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  45.52 
 
 
556 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.04 
 
 
556 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  49.23 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  44.27 
 
 
556 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  44.27 
 
 
556 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  47.24 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  47.33 
 
 
555 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  46.46 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  44.7 
 
 
551 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  44.27 
 
 
1496 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  46.02 
 
 
555 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  43.61 
 
 
556 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  42.75 
 
 
558 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  38.35 
 
 
557 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  45.52 
 
 
559 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  43.55 
 
 
556 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  36.8 
 
 
431 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  45.79 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  36.43 
 
 
554 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  41.28 
 
 
554 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  47.27 
 
 
559 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  42.52 
 
 
567 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  42.59 
 
 
539 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  41.54 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  39.45 
 
 
554 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  47.37 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  38.4 
 
 
432 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  37.04 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  43.93 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  43.93 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  50.98 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  45.16 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  42.97 
 
 
426 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  40.94 
 
 
557 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  36.79 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  50.49 
 
 
117 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  41.35 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  46.24 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  34.09 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  41.41 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  39.42 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  40.62 
 
 
426 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  40.38 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  37.27 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.88 
 
 
439 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  35.45 
 
 
501 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  44.21 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  35.4 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  44.21 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  38.54 
 
 
492 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  38.78 
 
 
492 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  40.62 
 
 
494 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  39.58 
 
 
492 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  39.58 
 
 
492 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  39.58 
 
 
492 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  39.58 
 
 
494 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  40.62 
 
 
492 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  41.11 
 
 
492 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  30.83 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  45.26 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  32.35 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  32.35 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  29.92 
 
 
165 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  30.95 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  32 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  37.8 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1671  hypothetical protein  27.34 
 
 
216 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>