More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3466 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  100 
 
 
110 aa  226  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  62.04 
 
 
109 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  62.04 
 
 
109 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  56.19 
 
 
113 aa  140  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  57.01 
 
 
113 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  55.24 
 
 
110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  53.27 
 
 
108 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  50.96 
 
 
259 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  124  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  49.52 
 
 
148 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  49.53 
 
 
124 aa  124  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  52.94 
 
 
110 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  50.96 
 
 
259 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  52.94 
 
 
110 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52.94 
 
 
123 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  47.06 
 
 
106 aa  121  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  59.34 
 
 
109 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.5 
 
 
109 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50.94 
 
 
115 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  54.17 
 
 
112 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.46 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  46.53 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.43 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.07 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  50 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  49.5 
 
 
105 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  52.83 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  49.5 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  48.11 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  49.02 
 
 
257 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  50.52 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  52.94 
 
 
106 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  51.96 
 
 
110 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  50.93 
 
 
109 aa  117  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  48.54 
 
 
109 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  50.52 
 
 
108 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  49.04 
 
 
110 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  49.02 
 
 
110 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  116  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  115  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  50.98 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  53.26 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  48.48 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  51.61 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  52.38 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  49.02 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.51 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  46.3 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  52.08 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  114  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.43 
 
 
107 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  47.06 
 
 
110 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  47.12 
 
 
109 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  49.02 
 
 
133 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  45.28 
 
 
109 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50.98 
 
 
108 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  46.67 
 
 
109 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>