178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3138 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3138  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1077  hypothetical protein  49.48 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3700  hypothetical protein  49.45 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  48.91 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  51.61 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  51.61 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3572  hypothetical protein  49.4 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  47.83 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  46.32 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0729  hypothetical protein  40.86 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.951229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  45.88 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  42.39 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  47.83 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  47.78 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  47.83 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  47.83 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  46.74 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  47.31 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  47.31 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  46.67 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  47.31 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  44.05 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  44.05 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1131  hypothetical protein  44.94 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0809  hypothetical protein  44.05 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1119  protein of unknown function UPF0044  44.44 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0127613  hitchhiker  0.0000000000583133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  44.05 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3426  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000346407  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3248  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000511442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2843  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000290881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3290  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000365798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  46.25 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  40.66 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  40 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3570  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000605463  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  41.67 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  43.21 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0998  hypothetical protein  43.48 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  43.21 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  43.21 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  43.21 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3398  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  decreased coverage  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0064  hypothetical protein  37.36 
 
 		 101 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.618195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0981  hypothetical protein  41.3 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000254887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  38.04 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0076  RNA-binding protein  36.26 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62880  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1018  hypothetical protein  39.53 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5473  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  36.67 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2172  hypothetical protein  42.68 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  36.78 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  36.78 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1637  hypothetical protein  39.51 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  30.95 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00160  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1723  protein of unknown function UPF0044  41.18 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2190  hypothetical protein  41.98 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0303198  normal  0.0370255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2031  protein of unknown function UPF0044  41.18 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1524  hypothetical protein  40.48 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.91908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  32.98 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  35.63 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4437  hypothetical protein  38.1 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2025  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3617  hypothetical protein  34.12 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.29 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1266  hypothetical protein  38.55 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0814  hypothetical protein  38.55 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  35.87 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1295  hypothetical protein  38.55 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0775  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1613  CRS1/YhbY domain-contain protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2778  CRS1/YhbY domain-contain protein  38.1 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.383882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  36.17 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1286  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0582  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1480  putative RNA-binding protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1510  putative RNA-binding protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0569  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.606782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>