186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2457 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  88.54 
 
 		 96 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  86.46 
 
 		 97 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  84.54 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  84.54 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  84.54 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  84.54 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  84.54 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  84.54 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  84.54 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  84.54 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  84.54 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  84.54 
 
 		 97 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  59.79 
 
 		 97 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  63.54 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  57.29 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  55.67 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  55.67 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  55.67 
 
 		 97 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  50.55 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  51.58 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  48.45 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2547  hypothetical protein  48.96 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0888013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  46.39 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  46.39 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  51.06 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  48.96 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1236  hypothetical protein  51.16 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000939316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  47.92 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1739  RNA-binding protein  45.56 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  44.44 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2495  hypothetical protein  49.44 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0230  RNA-binding protein  47.87 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  44.21 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  38.54 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0064  hypothetical protein  44.79 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.618195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00160  hypothetical protein  43.3 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.5 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1465  protein of unknown function UPF0044  43.75 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  37.36 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  38.54 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  44.79 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0076  RNA-binding protein  43.75 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  45.74 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  43.75 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  42.71 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  42.71 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  42.71 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  42.71 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  42.71 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  42.71 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  48.19 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  46.99 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  42.71 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  40.62 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  38.54 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  40.62 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  41.67 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  39.58 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  40.62 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  38.54 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  35.42 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0180  protein of unknown function UPF0044  40 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  39.58 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3572  hypothetical protein  40.82 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0261  hypothetical protein  36.56 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0272  protein of unknown function UPF0044  36.96 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  41.57 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1637  hypothetical protein  38.95 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0283  protein of unknown function UPF0044  36.96 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0907  RNA-binding protein  37.93 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.140498  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3570  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000605463  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  37.63 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0809  hypothetical protein  35.42 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  35.11 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  36.05 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>