177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1123 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  50.53 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  50.53 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  48.42 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  47.37 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2547  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0888013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  47.37 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  44.21 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  47.25 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  43.16 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  42.11 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  42.11 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  42.11 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  43.16 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  45.74 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  44.68 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0825  RNA-binding protein, YhbY family  40.7 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  35.11 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  42.7 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  39.13 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  43.33 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  41.05 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1236  hypothetical protein  39.53 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000939316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0981  hypothetical protein  41.57 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000254887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  42.7 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  40.45 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3398  hypothetical protein  42.7 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  decreased coverage  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0998  hypothetical protein  41.57 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  37.5 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2190  hypothetical protein  41.38 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0303198  normal  0.0370255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  35.23 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0942  hypothetical protein  40.23 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  34.74 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  37.76 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3570  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000605463  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0272  protein of unknown function UPF0044  39.18 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  39.33 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1131  hypothetical protein  44.71 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0283  protein of unknown function UPF0044  39.18 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0261  hypothetical protein  38.54 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  35.23 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1260  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2031  protein of unknown function UPF0044  39.18 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2613  hypothetical protein  36.9 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.846153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1723  protein of unknown function UPF0044  39.18 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  29.47 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1739  RNA-binding protein  37.08 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  29.47 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2864  protein of unknown function UPF0044  38.54 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0666776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  37.11 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2172  hypothetical protein  38.89 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  39.13 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0877  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932104  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3426  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000346407  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  37.08 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1266  hypothetical protein  42.05 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1119  protein of unknown function UPF0044  40.45 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0127613  hitchhiker  0.0000000000583133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3248  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000511442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2843  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000290881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3290  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000365798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  37.5 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  36.36 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  38.04 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  38.64 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1524  hypothetical protein  39.29 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.91908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0054  putative RNA-binding protein  41.57 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000142088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  36.36 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2854  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2737  hypothetical protein  36.47 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2358  protein of unknown function UPF0044  36.47 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.496102  hitchhiker  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  35.63 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  36.96 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  35.23 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  35.23 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2025  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0230  RNA-binding protein  34.38 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1266  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  35.23 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>