182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0283 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  323  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0283  protein of unknown function UPF0044  64.85 
 
 
177 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0272  protein of unknown function UPF0044  65.84 
 
 
170 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0261  hypothetical protein  64.63 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  48.51 
 
 
101 aa  94.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  55.26 
 
 
103 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  45.45 
 
 
98 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  45.83 
 
 
139 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  45.16 
 
 
104 aa  84.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  44.79 
 
 
100 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  44.79 
 
 
100 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  42.71 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  42.53 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  43.53 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  38.54 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  41.38 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  38.54 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  43.48 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  40 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  41.38 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62880  hypothetical protein  38.95 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5473  hypothetical protein  38.95 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  36.46 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  36.46 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  36.46 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  36.46 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  36.46 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  36.46 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  36.46 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  36.46 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  36.46 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  42.53 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1077  hypothetical protein  39.78 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  34.69 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4499  conserved hypothetical protein TIGR00253  40.45 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  38.14 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  38.14 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  38.14 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  38.14 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  32.29 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  38.14 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4189  hypothetical protein  40.45 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  35.37 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  35.11 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  36.78 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3617  hypothetical protein  39 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  37.23 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  41.46 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  37.23 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  35 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  35 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  39.76 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2495  hypothetical protein  42.42 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0942  hypothetical protein  36.05 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  37.35 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1524  hypothetical protein  32.76 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.91908  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  35.11 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  36.17 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  36.08 
 
 
110 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  35.11 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0770  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00791393  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  39.18 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  36.14 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  38.75 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  38.55 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2031  protein of unknown function UPF0044  36.67 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3700  hypothetical protein  39.58 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1723  protein of unknown function UPF0044  36.67 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4720  hypothetical protein  36.26 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  31.91 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2622  protein of unknown function UPF0044  37.11 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  36.14 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  36.14 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  34.88 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1734  protein of unknown function UPF0044  41.11 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.971373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  35.05 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  36.14 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  32.99 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0877  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932104  normal  0.0405734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>