179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0283 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0283  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 177 aa  330  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0272  protein of unknown function UPF0044  94.35 
 
 		 170 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0261  hypothetical protein  80.21 
 
 		 187 aa  257  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  64.85 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  50 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  55.13 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  40.23 
 
 		 88 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  47.06 
 
 		 100 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  47.06 
 
 		 100 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  43.14 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  43.62 
 
 		 98 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  42.68 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  42.35 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0942  hypothetical protein  34.35 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  41.3 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1077  hypothetical protein  40.48 
 
 		 101 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  36.96 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  39.18 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4499  conserved hypothetical protein TIGR00253  40.45 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4189  hypothetical protein  41.57 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62880  hypothetical protein  39.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  41.3 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5473  hypothetical protein  39.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  36.78 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  41.38 
 
 		 96 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  37.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  37.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  37.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1524  hypothetical protein  41.11 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.91908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  41.67 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0877  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932104  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  42.05 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2031  protein of unknown function UPF0044  39.56 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1723  protein of unknown function UPF0044  39.56 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  42.68 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  36.84 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  36.84 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  39.78 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  44.19 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  36.84 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  36.84 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  36.84 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  37.23 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2864  protein of unknown function UPF0044  37.5 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0666776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4720  hypothetical protein  35.11 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1260  hypothetical protein  38.33 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2190  hypothetical protein  35.34 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0303198  normal  0.0370255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2172  hypothetical protein  38.37 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  34.15 
 
 		 101 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2025  hypothetical protein  38.61 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  37.76 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  35.05 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  35.05 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1184  hypothetical protein  38.89 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0770  hypothetical protein  38.64 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00791393  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4437  hypothetical protein  38.89 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0814  hypothetical protein  43.04 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1172  hypothetical protein  38.89 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1295  hypothetical protein  43.04 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  39.76 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2613  hypothetical protein  39.08 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.846153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  38.37 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0775  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1613  CRS1/YhbY domain-contain protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2778  CRS1/YhbY domain-contain protein  38.89 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.383882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  39.76 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1286  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0582  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1480  putative RNA-binding protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1510  putative RNA-binding protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0569  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.606782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  39.56 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  38.64 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  38.64 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  37.63 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4721  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0712  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0375434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  42.05 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4586  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  38.64 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>