186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2315 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  71.88 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  69.07 
 
 		 98 aa  141  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  62.63 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2495  hypothetical protein  64.71 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  65.26 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  55.67 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  52.58 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  50.52 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  50.52 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  50.52 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  52.08 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  50.52 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  50.52 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  54.95 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  50.52 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  50.52 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  50.52 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  50.52 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  53.19 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  50.51 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  49.48 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  43.75 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  43.75 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  42.71 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  40.62 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  44.79 
 
 		 168 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  38.95 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  42.11 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  39.8 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  41.05 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1637  hypothetical protein  37.23 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2547  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0888013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.5 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0261  hypothetical protein  47.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  38.95 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0272  protein of unknown function UPF0044  47.06 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0283  protein of unknown function UPF0044  47.06 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  40 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  37.89 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  38.95 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  38.95 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  33.68 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  38.95 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0998  hypothetical protein  38.14 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  33 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  33 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3570  hypothetical protein  38.95 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000605463  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  38.95 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  38.95 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  45.78 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  36.84 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1131  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  37.89 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  40 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  37.89 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  46.84 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  36.17 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  36.84 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  35.79 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3398  hypothetical protein  36.84 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  decreased coverage  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  36.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  37.89 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  36.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  36.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1119  protein of unknown function UPF0044  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0127613  hitchhiker  0.0000000000583133 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1739  RNA-binding protein  40 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3426  hypothetical protein  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000346407  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3248  hypothetical protein  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000511442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2843  hypothetical protein  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000290881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3290  hypothetical protein  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000365798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  40.23 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0981  hypothetical protein  35.79 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000254887  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0907  RNA-binding protein  35.48 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.140498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  36.84 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4499  conserved hypothetical protein TIGR00253  41.05 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62880  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5473  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  35.79 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  40.7 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4720  hypothetical protein  36.56 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4586  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>