174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0076 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0076  RNA-binding protein  100 
 
 		 101 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0064  hypothetical protein  96.04 
 
 		 101 aa  196  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.618195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00160  hypothetical protein  72.28 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1465  protein of unknown function UPF0044  63.37 
 
 		 101 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  40.4 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  44.79 
 
 		 97 aa  84.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  44.79 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  42.71 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  42.71 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  41.41 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  41.41 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  41.41 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  41.41 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  41.41 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  38.78 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  43.75 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  42.27 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  41.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  43.75 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  40.4 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  43.33 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  41.24 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  42.27 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  42.27 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  42.27 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  44.21 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  43.82 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  42.27 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3570  hypothetical protein  39.18 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000605463  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  40.21 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  40.45 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  42.7 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0809  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  44.94 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3426  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000346407  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3248  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000511442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2843  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000290881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1119  protein of unknown function UPF0044  41.24 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0127613  hitchhiker  0.0000000000583133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3290  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000365798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  43.01 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  46.51 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0998  hypothetical protein  41.86 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3398  hypothetical protein  39.18 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  decreased coverage  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0981  hypothetical protein  39.18 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000254887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  40.23 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  47.67 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0590  putative RNA-binding protein  38.2 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00320322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1266  hypothetical protein  41.86 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1131  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2009  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.712889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1734  protein of unknown function UPF0044  40.23 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.971373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2622  protein of unknown function UPF0044  34.38 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  37.37 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62880  hypothetical protein  45.35 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5473  hypothetical protein  45.35 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  37.08 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0213  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0729  hypothetical protein  40.7 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.951229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1637  hypothetical protein  43.02 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4927  hypothetical protein  40.7 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  36.08 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  37 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  37 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  37 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3617  hypothetical protein  41.86 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4499  conserved hypothetical protein TIGR00253  41.86 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4189  hypothetical protein  43.02 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1473  protein of unknown function UPF0044  34.74 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2854  hypothetical protein  37.93 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2385  hypothetical protein  34.74 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.5 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0770  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00791393  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.5 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1723  protein of unknown function UPF0044  40.48 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2031  protein of unknown function UPF0044  40.48 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  37.5 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3572  hypothetical protein  41 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.5 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  35.63 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2615  hypothetical protein  35.23 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.655008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>