More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2821 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
106 aa  218  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.73 
 
 
137 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.52 
 
 
107 aa  152  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  41.49 
 
 
270 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46.53 
 
 
105 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  46.81 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  40.82 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  37.62 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.75 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.17 
 
 
526 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  37.62 
 
 
521 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 
114 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 
518 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  41.77 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.63 
 
 
521 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  38.78 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  34.74 
 
 
238 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  41 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.22 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.53 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.89 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  38.53 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.53 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.74 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.62 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.79 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.38 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.38 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  36.96 
 
 
291 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.2 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  39.78 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  39.78 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  39.78 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  37.78 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.58 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  38.95 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.63 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  38.95 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.94 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  37.86 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  33.64 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.23 
 
 
350 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.37 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  39.02 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  39 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.61 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.98 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.76 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 
521 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  39.73 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  36.89 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.89 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.22 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.7 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.89 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  33.72 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.13 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.91 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.08 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.79 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.65 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  35 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  40.54 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.89 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.96 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.41 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.25 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01974  benzene 1,2-dioxygenase ferredoxin protein  32.67 
 
 
109 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.3 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.96 
 
 
649 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.67 
 
 
504 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  32.61 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  43.86 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  32 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>