48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1070 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  100 
 
 
597 aa  1218    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  72.79 
 
 
594 aa  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  92.12 
 
 
622 aa  1137    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  36.99 
 
 
576 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.57 
 
 
279 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  33.98 
 
 
274 aa  90.5  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  32.29 
 
 
267 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  23.75 
 
 
504 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  28.24 
 
 
513 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  31.69 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  28.35 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  32.65 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  25.06 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  29.05 
 
 
280 aa  77  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.84 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  25.37 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  28.33 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  32.46 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  22.12 
 
 
472 aa  67  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.57 
 
 
288 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.32 
 
 
289 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  31.35 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  25 
 
 
260 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  24.46 
 
 
429 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  28.57 
 
 
315 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  27.68 
 
 
354 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.98 
 
 
242 aa  60.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.73 
 
 
307 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  24.54 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.34 
 
 
237 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.75 
 
 
242 aa  54.7  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  28.21 
 
 
251 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  29.19 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  22.66 
 
 
285 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  30.85 
 
 
355 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  23.11 
 
 
266 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  21.04 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.82 
 
 
215 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.79 
 
 
249 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  24.06 
 
 
282 aa  47.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  29.09 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  27.62 
 
 
240 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1164  hypothetical protein  28.9 
 
 
211 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00846992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  31.9 
 
 
214 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  26.7 
 
 
237 aa  43.9  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.91 
 
 
247 aa  43.9  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.91 
 
 
247 aa  43.5  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  28.1 
 
 
223 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0111191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>