76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4293 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  71.01 
 
 
188 aa  249  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  68.75 
 
 
188 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  66.67 
 
 
189 aa  237  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  56.11 
 
 
209 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  52.15 
 
 
187 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  49.09 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  47.34 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  43.68 
 
 
842 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  41.29 
 
 
799 aa  121  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  38.06 
 
 
192 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  36.26 
 
 
192 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  33.71 
 
 
206 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  37.89 
 
 
191 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  35.88 
 
 
207 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  37.89 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  33.14 
 
 
227 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  36.59 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  33.14 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  32.02 
 
 
236 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  32.52 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  33.13 
 
 
229 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  33.13 
 
 
221 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  32.56 
 
 
221 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  31.4 
 
 
224 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  35.09 
 
 
223 aa  91.3  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  33.74 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  29.63 
 
 
819 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  32.07 
 
 
810 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.16 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  30.67 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  26.83 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  30.64 
 
 
818 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  29.41 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  27.61 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  29.24 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 
443 aa  59.7  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  25.77 
 
 
400 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  25.15 
 
 
337 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  24.54 
 
 
337 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  25.6 
 
 
352 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  22.91 
 
 
813 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  25.27 
 
 
344 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25.73 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  25 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  27.88 
 
 
338 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  24.72 
 
 
364 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  27.88 
 
 
336 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  23.46 
 
 
366 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  23.39 
 
 
366 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  27.06 
 
 
338 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  26.67 
 
 
338 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  24.84 
 
 
328 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  26.67 
 
 
338 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  26.67 
 
 
338 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25.86 
 
 
316 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  24.39 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  25.61 
 
 
357 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  22.94 
 
 
315 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  23.6 
 
 
303 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  24.16 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  22.94 
 
 
315 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  24.48 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
925 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  23.49 
 
 
224 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  23.49 
 
 
244 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  23.49 
 
 
244 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25.15 
 
 
316 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  26.92 
 
 
357 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25.15 
 
 
316 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  25.15 
 
 
316 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  25.33 
 
 
341 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>