16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4938 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  33.33 
 
 		 944 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  27.32 
 
 		 475 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.16 
 
 		 1322 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0356  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0383  hypothetical protein  43.48 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0379  hypothetical protein  73.08 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  31.25 
 
 		 1426 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  29.51 
 
 		 1427 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1627  hypothetical protein  56.76 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1786  hypothetical protein  69.23 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  28.69 
 
 		 1422 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1790  hypothetical protein  66.67 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  28.36 
 
 		 718 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  30.91 
 
 		 954 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  26.72 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>